Le détective de la maladie

New York Times - 04/06
Joe Derisi a inventé un moyen de trouver des agents pathogènes que les scientifiques ne savaient même pas à rechercher. Peut-il aider à prévenir la prochaine pandémie?

Joe Derisi se souvient très clairement lorsque son obsession de maladies mystérieuses a commencé. En tant qu'adocageur dans les années 1980, grandir à l'extérieur de Sacramento, il a été rivé par des informations sur l'épidémie de sida, qui se répandait à ses débuts dans le monde entier et tue des milliers de personnes pendant que des scientifiques ont eu du mal à établir la cause. "Je veux dire, qu'est-ce que c'est?" Derisi dit. "Est-ce un virus? Personne ne savait! Tout le concept, que nous pourrions avoir une épidémie ou une pandémie mais que je ne pouvais pas comprendre ce qui était derrière cela - qui m'a coincé de toute ma vie. "

Aujourd'hui, Derisi est professeur de biochimie qui étudie des maladies infectieuses à l'Université de Californie, San Francisco et co-président du Biohub Chan Zuckerberg, un institut de recherche dans le quartier de la mission de la ville. Le maigre et les cheveux blancs à 51 ans, il a tendance à parler à des rafales rapides, parfois infléchi avec une ambiance de la Californie-Stoner. Quand je l'ai rencontré à la biohub en mai, il ressemble à de nombreux généticiens, venait de sortir d'une année hébreuse de travailler sur Covid-19, au cours de laquelle il a transformé son laboratoire en une installation pouvant traiter plus de 2 600 tests rapides par jour. "Les choses ont définitivement calmé", a déclaré Derisi, comme il m'a conduit à l'intérieur du biohub. "C'était assez intense pendant un moment."

Alors que nous avons fait une visite éclair du laboratoire, Derisi agita sa main à une série de séquenceurs génétiques coûteux, dont une la taille d'un réfrigérateur. "Boîtes grises ennuyeuses", a-t-il annoncé avant de continuer. Sur une table près du dos se trouvait une unité beaucoup plus petite, la nature simple et à peu près la taille d'une caisse de lait, avec un simple écran tactile. Peu de temps après de devenir président de la BioHub en 2016, Derisi a lancé un projet conçu pour repérer des maladies inconnues bien avant qu'ils ne soient normalement détectés. La boîte blanche, lorsqu'elle est connectée à un système d'analyse élaboré, Derisi avait conçue, permettait aux chercheurs du monde entier de participer à tous les différents ADN ou ARN rétablis à peu près à tous les tampons d'échantillonnage, tirages sanguins ou autres matériaux - et numérisez-le pour agents pathogènes non identifiés.

Le mot médical de ces maladies est "idiopathique": conditions dont les symptômes peuvent être décrits mais qui n'ont aucune cause connue. Avant que les germes n'étaient compris, la plupart des maladies étaient idiopathiques par définition, notamment la mort noire, que nous savons maintenant a été causée par une bactérie (yersinia pestis) mais que les médecins à l'époque peuvent être causés en regardant quelqu'un qui était malade, l'alignement des planètes, des mauvaises odeurs ou portent des chaussures pointues. Ce qui est surprenant, c'est combien d'infections mystérieuses existent encore aujourd'hui. Plus d'un tiers des maladies respiratoires aiguës sont idiopathiques; Il en va de même pour atteindre 40% des troubles gastro-intestinaux et plus de la moitié des cas d'encéphalite (gonflement du cerveau). Jusqu'à 20% des cancers et une partie substantielle des maladies auto-immunes, notamment la sclérose en plaques et la polyarthrite rhumatoïde, ont des déclencheurs viraux, mais une grande majorité de ceux qui n'ont pas encore été identifiés.

À l'échelle mondiale, les chiffres peuvent être encore pires et les enjeux sont souvent plus élevés. "Dis dire qu'une personne arrive à l'hôpital de Sierra Leone avec une fièvre et des symptômes flulistes", déclare Derisi. "Après quelques jours, ou une semaine, ils meurent. Qu'est-ce qui a causé cette maladie? La plupart du temps, nous ne découvrons jamais. Parce que si la cause n'est pas quelque chose que nous pouvons cultiver et tester pour "- comme l'hépatite ou la gorge de stress -", ​​il reste essentiellement un mystère. "

Bien que la cause de Covid-19 ait été rapidement identifiée comme un coronavirus, des notes Derisi, qui ne seront pas nécessairement le cas avec tout germe crée la prochaine pandémie. Et les stratégies antérieures pour détecter les virus potentiellement dangereux n'ont pas toujours été très systématiques. "Différents projets de prévention dans le passé ne font qu'une sorte de cheminée aléatoire sur le bord de la route et a cherché des virus dedans", m'a dit Derisi. "Ou ils chercheront tous les virus de la chauve-souris." Bien qu'il y ait une place pour ce type d'échantillonnage, Derisi a dit qu'il est difficile de savoir lequel des nombreux organismes découverts posent un risque. "Comme, nous avons un projet qui examine la boue dans les fermes porcines", a-t-il poursuivi. «Et nous avons identifié au moins 200 nouveaux virus de nouveaux virus. Qui est super! Mais nous n'avons aucune idée de laquelle de ceux-ci, le cas échéant, avoir la capacité de sauter chez l'homme - ou de la façon dont il serait mal...
[Courte citation de 8% de l'article original]

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