L'année 2021 a permis de vérifier que les mutations du SARS-CoV-2 avaient pour principal ressort une transmissibilité augmentée, l'une des stratégies normales d'un virus pour survivre. Deux chercheurs s'interrogent sur l'émergence des prochains variants à l'aune des milliers de combinaisons de mutations que le virus peut adopter selon son environnement et qui compliquent les prédictions.
Au début de l'année 2021, les bonnes nouvelles arrivaient enfin sur le front de la pandémie de Covid-19. Les premiers vaccins étaient disponibles et leur déploiement pouvait commencer à travers le monde, faisant espérer qu'on puisse apercevoir la lumière au bout du tunnel...
Malheureusement, l'euphorie aura été de courte durée, avec l'émergence fin 2020 du variant préoccupant « anglais » (variant of concern, B.1.1.7), nommé plus tard Alpha. Sa transmissibilité augmentée faisait craindre une accélération de la pandémie.
Le variant historique (Wuhan), qui avait cadenassé nos vies du jour au lendemain, avait un nombre de reproduction de base, ou R₀, de 3 (chaque personne infectée en pouvait infecter en moyenne trois autres). Les efforts inédits de la population (confinement, etc.) avaient fait descendre ce nombre en dessous de 1, indiquant que chaque malade contaminait moins d'un autre individu, laissant espérer une diminution du nombre de nouveaux cas.
Malheureusement, Alpha avait une transmissibilité environ 50 % plus importante que la souche historique, avec un nombre de reproduction de base approchan...
[Courte citation de 8% de l'article original]